Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp47Q8BY87 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp47Q8BY87 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp47Q8BY87 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp47Q8BY87 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp47Q8BY87 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Usp47Q8BY87 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp47Q8BY87 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp47Q8BY87 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp47Q8BY87 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp47Q8BY87 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Usp47Q8BY87 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms