Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms