Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
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Usp38Q8BW70 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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Usp38Q8BW70 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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Usp38Q8BW70 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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Usp38Q8BW70 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp38Q8BW70 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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