Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pdcl3Q8BVF2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcl3Q8BVF2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms