Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem260Q8BMD6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem260Q8BMD6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms