Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3c2Q8BL74 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3c2Q8BL74 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms