Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Atg4dQ8BGV9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Atg4dQ8BGV9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Atg4dQ8BGV9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Atg4dQ8BGV9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Atg4dQ8BGV9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg4dQ8BGV9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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