Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smndc1Q8BGT7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms