Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms