Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc38a9Q8BGD6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a9Q8BGD6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms