Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrtm2Q8BGA3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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