Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFV3

Dusp4, Dual specificity protein phosphatase 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp4Q8BFV3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dusp4Q8BFV3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dusp4Q8BFV3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dusp4Q8BFV3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dusp4Q8BFV3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dusp4Q8BFV3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dusp4Q8BFV3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dusp4Q8BFV3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dusp4Q8BFV3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Dusp4Q8BFV3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dusp4Q8BFV3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Dusp4Q8BFV3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dusp4Q8BFV3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dusp4Q8BFV3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms