Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M10.2Q85ZW9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M10.2Q85ZW9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M10.2Q85ZW9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M10.2Q85ZW9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M10.2Q85ZW9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M10.2Q85ZW9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M10.2Q85ZW9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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H2-M10.2Q85ZW9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M10.2Q85ZW9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M10.2Q85ZW9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M10.2Q85ZW9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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H2-M10.2Q85ZW9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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H2-M10.2Q85ZW9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M10.2Q85ZW9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M10.2Q85ZW9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M10.2Q85ZW9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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H2-M10.2Q85ZW9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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H2-M10.2Q85ZW9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M10.2Q85ZW9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M10.2Q85ZW9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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H2-M10.2Q85ZW9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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H2-M10.2Q85ZW9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M10.2Q85ZW9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
H2-M10.2Q85ZW9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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H2-M10.2Q85ZW9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M10.2Q85ZW9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M10.2Q85ZW9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M10.2Q85ZW9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M10.2Q85ZW9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M10.2Q85ZW9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M10.2Q85ZW9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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H2-M10.2Q85ZW9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M10.2Q85ZW9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M10.2Q85ZW9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M10.2Q85ZW9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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H2-M10.2Q85ZW9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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