Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms