Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc172Q810N9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc172Q810N9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms