Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cracr2bQ80ZJ8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cracr2bQ80ZJ8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms