Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TnnQ80Z71 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TnnQ80Z71 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TnnQ80Z71 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TnnQ80Z71 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TnnQ80Z71 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TnnQ80Z71 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TnnQ80Z71 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TnnQ80Z71 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TnnQ80Z71 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TnnQ80Z71 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TnnQ80Z71 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TnnQ80Z71 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TnnQ80Z71 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
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