Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg2bQ80XK6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms