Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk9Q80W65 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk9Q80W65 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Pcsk9Q80W65 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk9Q80W65 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk9Q80W65 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Pcsk9Q80W65 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk9Q80W65 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Pcsk9Q80W65 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pcsk9Q80W65 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Pcsk9Q80W65 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk9Q80W65 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk9Q80W65 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk9Q80W65 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Pcsk9Q80W65 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk9Q80W65 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk9Q80W65 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk9Q80W65 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk9Q80W65 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk9Q80W65 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk9Q80W65 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk9Q80W65 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk9Q80W65 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk9Q80W65 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pcsk9Q80W65 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pcsk9Q80W65 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pcsk9Q80W65 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pcsk9Q80W65 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pcsk9Q80W65 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pcsk9Q80W65 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pcsk9Q80W65 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pcsk9Q80W65 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pcsk9Q80W65 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pcsk9Q80W65 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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