Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sbno2Q7TNB8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sbno2Q7TNB8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sbno2Q7TNB8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sbno2Q7TNB8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sbno2Q7TNB8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms