Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMS5

Abcg2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg2Q7TMS5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg2Q7TMS5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms