Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox11Q7M6Y2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox11Q7M6Y2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms