Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ubfd1Q78JW9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ubfd1Q78JW9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ubfd1Q78JW9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ubfd1Q78JW9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ubfd1Q78JW9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ubfd1Q78JW9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubfd1Q78JW9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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