Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY3

Rps27l, 40S ribosomal protein S27-like, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27lQ6ZWY3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rps27lQ6ZWY3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps27lQ6ZWY3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms