Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc44a1Q6X893 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc44a1Q6X893 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms