Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Timd4Q6U7R4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Timd4Q6U7R4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Timd4Q6U7R4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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