Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAQ4

Rexo4, RNA exonuclease 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo4Q6PAQ4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rexo4Q6PAQ4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms