Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Cyp2d40Q6P8N9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cyp2d40Q6P8N9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms