Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A1

Stmnd1, Stathmin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stmnd1Q6P3A1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms