Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Asic1Q6NXK8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms