Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpbp1Q6NXH3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpbp1Q6NXH3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms