Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sohlh1Q6IUP1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms