Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep78Q6IRU7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cep78Q6IRU7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms