Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ParpbpQ6IRT3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms