Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hecw2Q6I6G8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hecw2Q6I6G8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms