Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Carmil1Q6EDY6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Carmil1Q6EDY6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms