Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg9bQ6EBV9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms