Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scaf8Q6DID3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms