Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Nop58Q6DFW4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nop58Q6DFW4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms