Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Pdzrn3Q69ZS0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Pdzrn3Q69ZS0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Pdzrn3Q69ZS0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Pdzrn3Q69ZS0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Pdzrn3Q69ZS0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzrn3Q69ZS0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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