Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrcc1Q69ZB0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrcc1Q69ZB0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrcc1Q69ZB0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrcc1Q69ZB0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrcc1Q69ZB0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrcc1Q69ZB0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrcc1Q69ZB0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrcc1Q69ZB0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrcc1Q69ZB0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrcc1Q69ZB0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrcc1Q69ZB0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrcc1Q69ZB0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrcc1Q69ZB0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrcc1Q69ZB0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrcc1Q69ZB0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms