Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z98

Brsk2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk2Q69Z98 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brsk2Q69Z98 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms