Protein–RNA interactions for Protein: Q64518

Atp2a3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a3Q64518 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp2a3Q64518 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp2a3Q64518 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms