Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pan3Q640Q5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms