Protein–RNA interactions for Protein: Q64028

Phc1, Polyhomeotic-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc1Q64028 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Phc1Q64028 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phc1Q64028 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms