Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AtmQ62388 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AtmQ62388 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AtmQ62388 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AtmQ62388 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AtmQ62388 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AtmQ62388 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtmQ62388 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtmQ62388 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtmQ62388 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtmQ62388 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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AtmQ62388 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtmQ62388 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtmQ62388 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
AtmQ62388 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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