Protein–RNA interactions for Protein: Q62348

Tsn, Translin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsnQ62348 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TsnQ62348 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TsnQ62348 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TsnQ62348 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TsnQ62348 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TsnQ62348 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsnQ62348 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsnQ62348 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsnQ62348 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsnQ62348 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsnQ62348 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TsnQ62348 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TsnQ62348 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms