Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sall3Q62255 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sall3Q62255 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms