Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssr4Q62186 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms