Protein–RNA interactions for Protein: Q61762

Kcna5, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna5Q61762 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcna5Q61762 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcna5Q61762 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcna5Q61762 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcna5Q61762 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcna5Q61762 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna5Q61762 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna5Q61762 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna5Q61762 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna5Q61762 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna5Q61762 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna5Q61762 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna5Q61762 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna5Q61762 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna5Q61762 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna5Q61762 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna5Q61762 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna5Q61762 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna5Q61762 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna5Q61762 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna5Q61762 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna5Q61762 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna5Q61762 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna5Q61762 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna5Q61762 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna5Q61762 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna5Q61762 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna5Q61762 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna5Q61762 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcna5Q61762 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms